القصر الجمهورى الوحدات التابعة
المحكمة الدستورية
مجلس العدل
ديوان العدالة القومى
الديوان القومي للمراجعة
مسجل التنظيمات والأحزاب السياسية
هيئة المظالم العامة
جهاز الأمن الوطنى
بنك السودان المركزى
المفوضية القومية للإنتخابات
مفوضية حقوق الإنسان
المفوضية القومية للخدمة القضائية
المفوضية القومية للخدمة المدنية
مفوضية تخصيص ومراقبة الإيرادات المالية
المفوضية القومية للأراضى
المفوضية القومية للبترول
المفوضية السياسية لوقف إطلاق النار
مفوضية تقويم تنفيذ اتفاقية السلام في ولايتى جنوب كردفان والنيل الأزرق
مفوضية حدود منطقة أبيى
مفوضية إستفتاء أبيى
المفوضية الخاصة بضمان حماية حقوق غير المسلمين في العاصمة القومية
اللجنة الخاصة بمتابعة وضمان الدقة والشرعية والشفافية في الاستفتاء
الوحدات المشتركة / المدمجة
مفوضية تقويم تنفيذ إتفاقية السلام
المفوضية القومية للمراجعة الدستورية
مجلس الإحصاء السكانى
مركز الدراسات الإستراتيجية
مجلس الصداقة الشعبية العالمية
مستشارية الجودة
وحدة تنفيذ السدود
المجلس القومى لتنسيق نزع السلاح والتسريح وإعادة الدمج
واتبع الى الرئاسة كذلك المجلس الأعلى للإستثمار الذي صدر بقرار جمهورى لاحق. *